Protein Data Bank

Protein Data Bank, PDB — банк данных трёхмерных структур белков и нуклеиновых кислот. Информация, полученная методами рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии, и, всё чаще, методом криоэлектронной микроскопии вносится в базу данных биологами и биохимиками со всего мира, и доступна бесплатно через интернет сайты организаций-членов (PDBe^[1], PDBj^[2], RCSB^[3]).

PDB является одним из важнейших ресурсов для учёных, работающих в области структурной биологии. Большинство научных журналов и некоторые фонды финансирования исследований, например, NIH в США требуют от авторов статей и получателей грантов, чтобы все структурные данные были размещены в PDB. Protein Data Bank содержит в основном первичные данные о структуре биологических молекул, в то время как существуют сотни других банков данных, категоризирующих первичные данные или выявляющие закономерности между строением молекул и эволюционным родством.^[4]

1. ↑ PDBe — Европейский Protein Data Bank  (неопр.). Дата обращения: 2 июня 2019. Архивировано 18 сентября 2019 года.
2. ↑ PDBj — японский Protein Data Bank  (неопр.). Дата обращения: 25 декабря 2009. Архивировано 18 сентября 2020 года.
3. ↑ Research Collaboratory for Structural Bioinformatics ([[Ратгерский университет|Rutgers]] и [[Суперкомпьютерный центр университета Сан Диего|UCSD/SDSC]]^{[[:en:San Diego Supercomputer Center|[англ.]]]})  (неопр.). Дата обращения: 25 декабря 2009. Архивировано 3 марта 2016 года.
4. ↑ Berman, H. M. The Protein Data Bank: a historical perspective (англ.) // Acta Crystallographica Section A: Foundations of Crystallography^[англ.] : journal. — International Union of Crystallography, 2008. — January (vol. A64, no. 1). — P. 88—95. — doi:10.1107/S0108767307035623. Архивировано 5 февраля 2009 года.