Heksagonalni kristalni sistem je eden od sedmih kristalnih sistemov. Sistem ima naslednje možne elemente simetrije: eno 6-števno simetrijsko os (oznaka 6), eno 3-števno os (3), največ šest 2-števnih osi (2), največ sedem ravnin simetrije (m), en center simetrije (1) ter njihove kombinacije. Sistem ima samo eno Bravaisovo mrežo, ki jo nekateri viri označujejo kot osnovno centrirano (C), drugi pa kot primitivno (P).
Heksagonalna osnovna celica ima naslednje mrežne parametre:
Značilen primer snovi s heksagonalnimi kristali je grafit.