Med podzemeljsko favno sodijo živalske vrste, ki so prilagojene na življenje v podzemeljskem okolju. Troglofavna in stigofavna sta dva tipa podzemeljske favne; obe kategoriji sta povezani s podzemeljskimi (hipogejičnimi) habitati – troglofavna prebiva v kopenskih predelih podzemlja (jamah in drugih podzemnih prostorih nad vodno gladino), medtem ko stigofavno povezujemo z vsemi tipi podzemeljskih voda (podtalnico, vodonosniki, ponikalnicami ipd.).