WD domen, G-beta ponavljanje | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Trakasti dijagram C-terminalnog WD40 domena proteina Tup1 (transkripcionog korepresora kod kvasca), koji poprima oblik beta-propelera sa sedam lopatica. Traka je obojena od plavog N-terminusa do crvenog C-terminusa.[1] | |||||||||
Identifikatori | |||||||||
Simbol | WD40 | ||||||||
Pfam | PF00400 | ||||||||
Pfam klan | CL0186 | ||||||||
InterPro | IPR001680 | ||||||||
PROSITE | PDOC00574 | ||||||||
SCOP | 1gp2 | ||||||||
SUPERFAMILY | 1gp2 | ||||||||
CDD | cd00200 | ||||||||
|
U strukturnoj biologiji, beta-propeler je tip sve-β proteinskog savijanja koje ima oblik beta ravni sa karakterističnom grupom od 4 do 8 lopatica koje su torusno raspoređene oko centralne ose. Svaka ravan tipično ima četiri antiparalna β-lanca. Oni su povijeni tako da su prvi i četvrti lanac skoro međusobno normalni. Aktivno mesto enzima se obično nalazi u otvoru formiranom u centru propelera od petlji koje povezuju uzastopne četvorolančane motive. Murzin je predložio geometrijski model za opisivanje strukturnih principa beta propelera.[2] Po tom modelu propeler sa sedam lopatica je najpovoljniji sa geometrijskog gledišta.