Klonkrigen, (engelska: Clone Wars) stjärnornas krigs första konflikt som slutligen leder till skapande av Rymdimperiet. Klonkrigen utspelar sig i Star Wars Episod II - och III. TV-serien Star Wars: The Clone Wars.[1] Många av galaxens största slag, till exempel slaget vid Geonosis, slaget vid Kashyyyk och slaget vid Utapau äger rum i klonkriget.
Klonkrigen har fått sitt namn ifrån faktumet att klonsoldaterna var de som jämnade ut kriget till republikens fördel. Men i slutet av klonkrigen utförs Order 66, och republiken förlorar.