Theodor Zahn, född 10 oktober 1838 i Moers, död 5 mars 1933 i Erlangen, var en tysk evangelisk teolog.
Till hans viktigaste forskningsområden hörde patristik och utvecklingen av Nya Testamentets kanon. Zahn arbetade i en konservativ tradition och var uppskattad för sin lärdom och grundlighet, något som kan ses på den mängd referenser till hans verk som ges i samtida litteratur.