UniProt

UniProt

İçerik
Açıklama	UniProt, Swiss-Prot, TrEMBL ve PIR-PSD veritabanının birleştirilmesiyle oluşturulan protein verilerinin merkezi bir deposu olan Universal Protein kaynağıdır.
Yakalanan veri türleri	Protein açıklaması
Organizmalar	Tümü
İletişim
Araştırma merkezi	EMBL-EBI, Birleşik Krallık; SIB, İsviçre; PIR, ABD.
Birincil alıntı	UniProt Konsorsiyumu[1]
Erişim
Veri formatı	Özel düz dosya, FASTA, GFF, KTÇ, XML.
İnternet sitesi	uniprot.org uniprot.org/news/
İndirme bağlantısı	uniprot.org/downloads & tüm veri setlerini indirmek için ftp.uniprot.org
Web hizmeti bağlantısı	Evet - Java API bilgi için bakınız here & REST bilgi için bakınız here
Araçlar
Web	Gelişmiş arama, BLAST, ClustalO, toplu alma/indirme, kimlik eşleme
Diğer
Lisans	Creative Commons Attribution-NoDerivs
Sürümleme	Evet
Veri yayınlama sıklığı	8 hafta
Kürasyon politikası	Evet - manuel ve otomatik. Veritabanı küratörleri ve hesaplama algoritmaları tarafından oluşturulan otomatik açıklama kuralları.
Yer imi konulabilir varlıklar	Evet - hem bireysel protein girişleri hem de aramalar

UniProt, genom dizileme projelerinden elde edilen birçok girdiden oluşan, serbestçe erişilebilen bir protein dizisi ve fonksiyonel bilgi veritabanıdır. Araştırma literatüründen elde edilen proteinlerin biyolojik işlevi hakkında büyük miktarda bilgi içerir. Çeşitli Avrupa biyoenformatik kuruluşlarından ve Washington, DC, ABD'den bir vakıftan oluşan UniProt konsorsiyumu tarafından sürdürülmektedir.

1. ^ UniProt, Consortium. (January 2015). "UniProt: a hub for protein information". Nucleic Acids Research. 43 (Database issue). ss. D204-12. doi:10.1093/nar/gku989. PMC 4384041 $2. PMID 25348405.