HDAC2

HDAC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3MAX, 4LXZ, 4LY1
Ідентифікатори
Символи	HDAC2, HD2, RPD3, YAF1, histone deacetylase 2, KDAC2
Зовнішні ІД	OMIM: 605164 MGI: 1097691 HomoloGene: 68187 GeneCards: HDAC2
Реагує на сполуку
apicidin, belinostat, Масляна кислота, entinostat, givinostat, mocetinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, золінза, Viroporin 3a[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleosomal DNA binding • heat shock protein binding • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • enzyme binding • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • protein deacetylase activity • chromatin binding • NF-kappaB binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific DNA binding • hydrolase activity • histone deacetylase activity • RNA binding • histone deacetylase binding • deacetylase activity • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • NuRD complex • ESC/E(Z) complex • Sin3 complex • Хроматин • нуклеоплазма • histone deacetylase complex • GO:0009327 protein-containing complex • Sin3-type complex • мембрана • integral component of membrane Біологічний процес • cellular response to retinoic acid • cellular response to heat • ритмічний процес • response to amphetamine • negative regulation of DNA binding • cardiac muscle hypertrophy • odontogenesis of dentin-containing tooth • positive regulation of proteolysis • positive regulation of interleukin-1 production • response to cocaine • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • positive regulation of collagen biosynthetic process • histone H3 deacetylation • ремоделювання хроматину • negative regulation of peptidyl-lysine acetylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to nicotine • embryonic digit morphogenesis • negative regulation of MHC class II biosynthetic process • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • histone H4 deacetylation • fungiform papilla formation • positive regulation of tumor necrosis factor production • response to caffeine • negative regulation of dendritic spine development • hair follicle placode formation • epidermal cell differentiation • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • negative regulation of neuron projection development • response to hyperoxia • dendrite development • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • eyelid development in camera-type eye • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • circadian regulation of gene expression • response to lipopolysaccharide • behavioral response to ethanol • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to dopamine • зсідання крові • positive regulation of cell population proliferation • histone deacetylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to hydrogen peroxide • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of male mating behavior Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3066	15182
Ensembl	ENSG00000196591	ENSMUSG00000019777
UniProt	Q92769	P70288
RefSeq (мРНК)	NM_001527	NM_008229
RefSeq (білок)	NP_001518	NP_032255
Локус (UCSC)	Хр. 6: 113.93 – 114.01 Mb	Хр. 10: 36.85 – 36.88 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HDAC2 (англ. Histone deacetylase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 488 амінокислот, а молекулярна маса — 55 364^[5].

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з histone deacetylase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. ↑ Human PubMed Reference:.
3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4853 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-28 у Wayback Machine.]
5. ↑ UniProt, Q92769 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.