MMP1

MMP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AYK, 1CGE, 1CGF, 1CGL, 1HFC, 1SU3, 2AYK, 2CLT, 2J0T, 2TCL, 3AYK, 3SHI, 4AUO, 4AYK
Ідентифікатори
Символи	MMP1, CLG, CLGN, matrix metallopeptidase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 120353 MGI: 1933846 HomoloGene: 20544 GeneCards: MMP1
Реагує на сполуку
	cipemastat
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity; • zinc ion binding; • endopeptidase activity; • metalloendopeptidase activity; • hydrolase activity; • metallopeptidase activity; • зв'язування з іоном металу; • serine-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• collagen catabolic process; • extracellular matrix disassembly; • GO:0022415 viral process; • leukocyte migration; • протеоліз; • positive regulation of protein oligomerization; • cytokine-mediated signaling pathway; • extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4312
	83995
	ENSG00000196611
	ENSMUSG00000043089
	P03956
	Q9EPL5
	NM_002421; NM_001145938
	NM_032006
	NP_001139410; NP_002412
	NP_114395
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MMP1 (англ. Matrix metallopeptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 54 007^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHSFPPLLLL	LFWGVVSHSF	PATLETQEQD	VDLVQKYLEK	YYNLKNDGRQ
VEKRRNSGPV	VEKLKQMQEF	FGLKVTGKPD	AETLKVMKQP	RCGVPDVAQF
VLTEGNPRWE	QTHLTYRIEN	YTPDLPRADV	DHAIEKAFQL	WSNVTPLTFT
KVSEGQADIM	ISFVRGDHRD	NSPFDGPGGN	LAHAFQPGPG	IGGDAHFDED
ERWTNNFREY	NLHRVAAHEL	GHSLGLSHST	DIGALMYPSY	TFSGDVQLAQ
DDIDGIQAIY	GRSQNPVQPI	GPQTPKACDS	KLTFDAITTI	RGEVMFFKDR
FYMRTNPFYP	EVELNFISVF	WPQLPNGLEA	AYEFADRDEV	RFFKGNKYWA
VQGQNVLHGY	PKDIYSSFGF	PRTVKHIDAA	LSEENTGKTY	FFVANKYWRY
DEYKRSMDPG	YPKMIAHDFP	GIGHKVDAVF	MKDGFFYFFH	GTRQYKFDPK
TKRILTLQKA	NSWFNCRKN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7155 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P03956 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7155 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P03956 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

MMP1

From Wikipedia, the free encyclopedia · View on Wikipedia